【本书首发网站长子术赤统辖宽田吉思海(今里海)以北及原花刺子模王国的领土；次子察合台统辖东至伊犁河流域，包括焉耆以西地区，西至阿姆河流域的土地；三子窝阔台统辖准噶尔盆地北部，包括今塔城、阿勒泰地区和蒙古的西部。由于高昌亦都护最先降附蒙古，因此受到特别优待，允许保留自己的领地。1227年，成吉思汗死，窝阔台及其子贵由先后继任为大汗。1251年，蒙哥被推举为大汗。蒙哥汗在西域设立了别失八里和阿姆河等处行尚书省，以加强行政管理。他任命亲信纳怀、塔刺海、麻速忽(即马思忽惕)等为别失八里等处行尚书省事，以管辖今新疆及巴尔喀什湖以东以南的广大地区；任命阿儿浑为阿姆河等处行尚书省事，以管辖河中地区，还任命维吾尔人帖哥术探花爱忽赤管辖哈密、库车等地。1260年，忽必烈在开平(今内蒙古多伦北)被推举为大汗。当时，其弟阿里不哥驻守和林，也自称大汗。兄弟之间为争夺汗位而展开激烈的斗争，也影响到新疆和中亚地区，双方都欲借助察合台汗国控制的土地和人口取得优势。1264年，忽必烈降服阿里不哥。1279年灭南宋，元朝，统一了全国。
忽必烈采取措施对西北诸王加强控制，他诏令窝阔台后裔海都入觐，把察合台后裔八刺派往察合台领地，控制当地形势。海都拒不入朝，并于1269年在塔拉斯河谷召集西北蒙古诸王大会，以保持游牧生活与蒙古习俗为口号，反对忽必烈。他们南侵畏兀儿之地，甚至越过阿尔泰山向东侵犯哈喇和林。忽必烈为防御海都叛军，于
1267年命皇子那木罕统军镇守阿力麻里，命綦公直驻守别失八里。1281年，改畏吾断事官为北庭都护府，在别失八里、火州(和州)、兀丹(和阗)等地设宣慰司。1295年，元朝政府又设立北庭都元帅府、曲先塔林都元帅府，以加强对新疆地区的管理。
蒙古的西下及其对西域和中亚等地区的统治，导致了这一时期的民族大迁徙和大融合。成吉思汗西征时，其军队中有大量征发来的女真人、契丹人、汉人、畏兀儿人和西夏人，其中不少成为驻守当地的军官和政府官吏。为防御西北诸王的反叛和解决驻军后勤供应问题，元世祖忽必烈灭宋以后，把大量的汉军、新附军和农民、工匠征发到西北，在别失八里、斡端(今和田)、哈迷里(今哈密)屯田，并置冶场，鼓铸农具、兵器等。在民族迁徙中，不仅有从蒙古草原和中原等地区迁往新疆和中亚地区的各族移民，而且有不少新疆和中亚地区的居民迁往内地。在成吉思汗西征时期，攻克每一个大城市之后，几乎都要将大批工匠、居民编入军队，签发到东方，这些工匠艺人大部分迁入从河西一直到中原的广大地区。元朝建立以后，有不少畏兀儿人在中央和地政府中任职，有些则是著名的科学家、文学家和艺术家。
蒙古的西下及其对新疆和中亚地区的统治，使各民族之间有了更广泛、更密切的接触，从而产生了民族间的同化、融合，导致了一些新民族的形成。回族、哈萨克族、乌孜别克族，以及近代维吾尔族的形成，都与蒙古族在新疆和中亚地区的活动有密切关系。蒙古的统治将各民族熔铸于一炉，客观上对加强各民族间的经济、文化交流，为进一步发展经济、文化创造了条件。
辛亥革命前后新疆各族人民的反帝爱国斗争，19世纪末至20世纪初，帝国主义进一步扩大对新疆的侵略，涉及到政治、经济、军事、文化等各个领域。新疆各族人民的反帝爱国斗争从未停息过，南疆策勒村人民的抗俄斗争就是最典型的例子。
居住在南疆策勒村(当时属于阗县)的沙俄商人色依提阿吉一贯欺压人民，1912年6月16日，又因霸占水利、毒打群众，激起民愤。村民在苏朴尔格带领下与之斗争。6月24日，喀什参将熊高升奉命去处置，色依提阿吉竟然指使人开枪打死熊的部下及其群众多人。策勒村人民愤怒了，他们奋起反击，烧其住宅，击毙沙俄侵略者及其爪牙数十人，色依提阿吉仓皇出逃。这就是震惊中外的“策勒村事件”。尽管袁世凯政府屈服于沙俄的淫威，屈辱地处理了这一事件，但策勒村人民的反帝爱国精神却永远载入了史册。
在反侵略斗争中，涌现出了许多杰出人物。如：塔吉克族英雄库尔察克为保卫家园，在与浩罕入侵者的战斗中壮烈牺牲；哈萨克族抗俄英雄塔扎别克率部回归祖国，与沙俄侵略者进行了殊死搏斗；藏传佛教活佛棍噶扎拉参在阿勒泰大义凛然，愤怒谴责沙俄入侵者；南疆维吾尔族村民苏朴尔格等，在策勒村事件中勇斗沙俄侵略者及其走狗，不屈不挠。他们的英雄事迹，永远激励着新疆各族人民。
由于阿古柏入侵新疆，造成了我国西北边疆的严重危机。沙俄乘机而入，出兵强占我国伊犁，并将其势力向新疆各地浸透，使危机急剧加深。伊犁各族人民不甘屈服，与侵略者进行了殊死搏斗。他们坚持抵抗了50多个日日夜夜，为保卫祖国的领土主权流血牺牲，付出了沉重的代价。
伊犁是新疆最富饶的地区之一。山河壮丽，资源富足，有优美的草场发展牧业，有肥沃的土壤、充足的水资源，宜于农业。1884年新疆建省之前，伊犁是新疆的政治、经济中心，伊犁将军统辖全疆。
忽必烈采取措施对西北诸王加强控制，他诏令窝阔台后裔海都入觐，把察合台后裔八刺派往察合台领地，控制当地形势。海都拒不入朝，并于1269年在塔拉斯河谷召集西北蒙古诸王大会，以保持游牧生活与蒙古习俗为口号，反对忽必烈。他们南侵畏兀儿之地，甚至越过阿尔泰山向东侵犯哈喇和林。忽必烈为防御海都叛军，于
1267年命皇子那木罕统军镇守阿力麻里，命綦公直驻守别失八里。1281年，改畏吾断事官为北庭都护府，在别失八里、火州(和州)、兀丹(和阗)等地设宣慰司。1295年，元朝政府又设立北庭都元帅府、曲先塔林都元帅府，以加强对新疆地区的管理。
蒙古的西下及其对西域和中亚等地区的统治，导致了这一时期的民族大迁徙和大融合。成吉思汗西征时，其军队中有大量征发来的女真人、契丹人、汉人、畏兀儿人和西夏人，其中不少成为驻守当地的军官和政府官吏。为防御西北诸王的反叛和解决驻军后勤供应问题，元世祖忽必烈灭宋以后，把大量的汉军、新附军和农民、工匠征发到西北，在别失八里、斡端(今和田)、哈迷里(今哈密)屯田，并置冶场，鼓铸农具、兵器等。在民族迁徙中，不仅有从蒙古草原和中原等地区迁往新疆和中亚地区的各族移民，而且有不少新疆和中亚地区的居民迁往内地。在成吉思汗西征时期，攻克每一个大城市之后，几乎都要将大批工匠、居民编入军队，签发到东方，这些工匠艺人大部分迁入从河西一直到中原的广大地区。元朝建立以后，有不少畏兀儿人在中央和地政府中任职，有些则是著名的科学家、文学家和艺术家。
蒙古的西下及其对新疆和中亚地区的统治，使各民族之间有了更广泛、更密切的接触，从而产生了民族间的同化、融合，导致了一些新民族的形成。回族、哈萨克族、乌孜别克族，以及近代维吾尔族的形成，都与蒙古族在新疆和中亚地区的活动有密切关系。蒙古的统治将各民族熔铸于一炉，客观上对加强各民族间的经济、文化交流，为进一步发展经济、文化创造了条件。
辛亥革命前后新疆各族人民的反帝爱国斗争，19世纪末至20世纪初，帝国主义进一步扩大对新疆的侵略，涉及到政治、经济、军事、文化等各个领域。新疆各族人民的反帝爱国斗争从未停息过，南疆策勒村人民的抗俄斗争就是最典型的例子。
居住在南疆策勒村(当时属于阗县)的沙俄商人色依提阿吉一贯欺压人民，1912年6月16日，又因霸占水利、毒打群众，激起民愤。村民在苏朴尔格带领下与之斗争。6月24日，喀什参将熊高升奉命去处置，色依提阿吉竟然指使人开枪打死熊的部下及其群众多人。策勒村人民愤怒了，他们奋起反击，烧其住宅，击毙沙俄侵略者及其爪牙数十人，色依提阿吉仓皇出逃。这就是震惊中外的“策勒村事件”。尽管袁世凯政府屈服于沙俄的淫威，屈辱地处理了这一事件，但策勒村人民的反帝爱国精神却永远载入了史册。
在反侵略斗争中，涌现出了许多杰出人物。如：塔吉克族英雄库尔察克为保卫家园，在与浩罕入侵者的战斗中壮烈牺牲；哈萨克族抗俄英雄塔扎别克率部回归祖国，与沙俄侵略者进行了殊死搏斗；藏传佛教活佛棍噶扎拉参在阿勒泰大义凛然，愤怒谴责沙俄入侵者；南疆维吾尔族村民苏朴尔格等，在策勒村事件中勇斗沙俄侵略者及其走狗，不屈不挠。他们的英雄事迹，永远激励着新疆各族人民。
由于阿古柏入侵新疆，造成了我国西北边疆的严重危机。沙俄乘机而入，出兵强占我国伊犁，并将其势力向新疆各地浸透，使危机急剧加深。伊犁各族人民不甘屈服，与侵略者进行了殊死搏斗。他们坚持抵抗了50多个日日夜夜，为保卫祖国的领土主权流血牺牲，付出了沉重的代价。
伊犁是新疆最富饶的地区之一。山河壮丽，资源富足，有优美的草场发展牧业，有肥沃的土壤、充足的水资源，宜于农业。1884年新疆建省之前，伊犁是新疆的政治、经济中心，伊犁将军统辖全疆。